多元生物資訊分析台灣本土癌症RNA次世代定序數據研究人類內源性反轉錄病毒的致癌因子(1/2)

研究計畫: A - 政府部門b - 科技部

專案詳細資料

說明

致癌原因若瞭解越多, 則就越能針對關鍵因子做更有效的標靶性治療。癌症的共同 風險因子包括家族史、老化、吸煙、不良飲食或外來病菌感染等,然而癌症的致命性仍 如同50 年前一樣的嚴重。因此,癌症的研究有必要做更多不同角度、不同模式的開發 與探究。隨著生物科技的快速進步,尤其像次世代定序方法的進展,研究學者才開始注 意到一塊以前被視為垃圾DNA(Junk DNA)的領域, 原來這段絕大部分都有轉錄RNA 活性的能力, 且佔了全基因組的93%, 是謂非譯碼RNA(Non-coding RNA), 相對於只 佔1.2%的譯碼序列, 是一塊尚未開發的未知領域。而其中已經存在生物體內超過兩千五 百萬年的人類內源性反轉錄病毒(Human Endogenous Retrovirus, HERV)序列, 並佔全 基因組的8%, 其表現量的異常是否也是癌症的風險因子之一, 是一個值得深入探討的 問題。 我們之前利用公開擷取的癌症RNA-seq data 的分析證實HERVs 的確與癌症的風險 有關。此次提出的二年期研究計畫是希望用高品質收取的本土型三種癌症, 大腸直腸 癌、乳癌與肺腺癌各六對檢體, 共36 組巨型RNA-seq 數據, 分析差異性HERVs, 進而利 用不同的生資工具分析比較種族間的HERV 多樣性、HERVs 的coding 蛋白功能、HERVs 與宿主間的交互作用、以及內源性與外源性病毒的交互作用等重要課題,此結果將有助 於認識癌症, 找到新的風險因子, 並精進癌症的標靶療法。
狀態已完成
有效的開始/結束日期8/1/157/31/16