運用癌症基因表現建構癌症相關生物路徑

研究計畫: A - 政府部門b - 科技部

說明

生物路徑是生物體內最重要的生物過程之一。在今日,預測或重構路徑的研究都 要仰賴電腦方法搭配基因組學與蛋白質組學的資訊。然而,即便如此,我們在路 徑研究上對於全規模基因組與大規模蛋白質組的運用仍然有限。在龐大的蛋白質 交互作用網路中尋找出有意義的生物路徑是很困難的。另一方面,基因表現又比 蛋白質交互作用更貼近路徑的調控。所以,我們提出了一個可以整合基因表現與 蛋白質交互作用的方法,由不同狀態下基因改變的強度來推論可能的路徑片段。 在此同時,我們要為本研究來設計一個工具,並且運用多種癌症的基因表現資料 來驗證它。由我們的方法產生的結果將與各種路徑預測法(如:最短路徑法、 NetSearch 法…等)的路徑預測方法來做比較。這個研究應可證明蛋白質交互作 用搭配基因表現的改變強度來推論的路徑,在生物學上可以更具有意義。期待本 方法能夠對於癌症的治療提供一個新的視野。
狀態已完成
有效的開始/結束日期8/1/137/31/14

Keywords

  • 生物路徑
  • 蛋白質交互作用網路
  • 基因表現
  • 癌症