轉錄體分析應用於探討替代式剪接反應串聯效應對棕色脂肪細胞分化與其生理功能之影響

研究計畫: A - 政府部門b - 科技部

說明

脂肪組織在調節生物體內能量平衡扮演舉足輕重的作用,在哺乳動物中目前已知存在白色脂肪組織 (WAT)與褐色脂肪組織(BAT)。褐色脂肪組織已被證明在小型囓齒類動物,冬眠動物或小嬰兒體 內,可經由非顫抖性機制來產生熱量,也因此棕色脂肪組織被認為是抑制肥胖的重要機制之一。即便 如此,褐色脂肪組織在成人體內的表現情形、確切功能與分化發展的生理機制仍所知有限。 替代性剪接(Alternative splicing)是高等真核細胞中增進轉錄組(Transcriptome)多樣性的重要機 制,超過90%的人類基因會經由此機制產生至少一種以上的信息核醣核酸(mRNA),可轉錄出生理特 性相異的蛋白質亞型,藉此調控基因表現與活性。受限於某一基因產生之多個mRNA 產物的表現量或 差異性多不明顯,全轉錄組定序法為目前最適合的分析方法。在本人前期計畫中,已成功利用全轉錄 組定序,比對出多個替代性剪接圖譜受到RBM4 此一RNA 結合蛋白調控的基因,並探討其與RBM4 蛋白對棕色脂肪細胞分化與功能之影響。實驗結果已陸續發表於BBA-Molecular Cell Research、RNA Biology 期刊以及在Scientific Reports 期刊審稿中。本計劃主要將利用本實驗室已建立之全轉錄組定序 法,全面性搜尋,並嘗試建立參與棕色脂肪細胞分分化與其生理功能之替代性剪接網路。
狀態已完成
有效的開始/結束日期8/1/167/31/17

Keywords

  • 替代性剪接
  • 棕色脂肪細胞
  • 轉錄組分析
  • 次世代定序