次世代RNA定序數據分析人類內源性逆轉錄病毒與癌症的關係

研究計畫: A - 政府部門b - 科技部

說明

目前研究已知大約 15-20%癌症的發生是由於病毒感染所造成, 因此, 已經存在生物 體內超過兩千五百萬年的內源性逆轉錄病毒, 其表現量的異常是否也和癌症的發生有關 係, 就是一個相當值得探討的問題。直到近年因為生物科技的快速演進,尤其像次世代 定序分析方法的純熟,研究學者才開始定睛到這塊以前被視為垃圾DNA(Junk DNA) 的領域, 也才逐漸理解這段絕大部分都有產生 RNA活性的能力, 其中這些非譯碼 RNA (non-coding RNA)中, 人類內源性逆轉錄病毒(Human Endogenous Retrovirus, HERV) 佔其中的 8%, 一個完整HERV序列包括 gag, pol, env 3 個結構基因和兩端 LTR重複序 列。 以往的研究方式都是用生物實驗的方法直接鑑定少數幾個HERV序列在特定癌症的 表現差異, 我們此次提出的兩年期研究計畫構想是利用完整、高通量產出 RNA序列的次 世代 RNA-Seq 定序數據資料, 全面掃描所有在人類基因體中的HERV序列, 接下來才再 經由生物實驗的方法一一驗證, 相信經由詳實、完整的資料收集, 與巨集資料分析, 將有 助於揭開HERVs 在疾病上扮演的角色。
狀態已完成
有效的開始/結束日期8/1/147/31/15