Antimicrobial Resistance Genetic Biomarkers: a Pan-Genome-Based Novel Approach for Pinpointing Antimicrobial Resistance Biomarkers from Bacterial Genomic Sequences (1/3)

Project: A - Government Institutionb - Ministry of Science and Technology

Project Details

Description

細菌抗藥性仍然是個相當難解的醫療問題。醫療院所治療細菌感染時,第一步往往就是開廣效抗生素。但是越來越多的抗藥性細菌意味著廣效抗生素不但可能無效,還有可能刺激突變而產生更高的抗性。因此第一時間了解細菌是否對即將開立的抗生素帶有抗藥性是很重要的,因為能否在第一時間抑制與殺死細菌而不讓其繼續繁殖產生抗藥性才是治療細菌感染的不二法門。我在這份計畫中提出了一套尋找細菌抗藥性生物標記的演算法,用來尋找可以更準確預測細菌抗藥性的基因或是其他基因體上的生物標記。我並將會透過不同的資料以及不同的計算方法交叉比對生物標記的準確度以及靈敏度。期望這些生物標記不但能夠拓展對抗藥性的知識,並能建立準確度更高的預測模型。
StatusActive
Effective start/end date8/1/227/31/23

Keywords

  • antimicrobial resistance
  • pan-genome
  • feature selection
  • biomarker